Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms