Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms