Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms