Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms