Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms