Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms