Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MRE11P49959 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRE11P49959 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms