Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms