Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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