Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRHP20396 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRHP20396 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRHP20396 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRHP20396 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms