Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPGDP15428 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPGDP15428 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms