Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms