Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH1P12830 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH1P12830 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH1P12830 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH1P12830 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDH1P12830 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDH1P12830 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDH1P12830 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDH1P12830 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH1P12830 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms