Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms