Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms