Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSVO60911 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms