Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPLO60437 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPLO60437 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPLO60437 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms