Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP104O60308 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP104O60308 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP104O60308 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms