Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIREO43918 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIREO43918 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIREO43918 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIREO43918 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIREO43918 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIREO43918 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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AIREO43918 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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AIREO43918 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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AIREO43918 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AIREO43918 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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