Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms