Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP17L13C9JLJ4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms