Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms