Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms