Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms