Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms