Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms