Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms