Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAPAQ9P0L0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms