Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0B6

CCDC167, Coiled-coil domain-containing protein 167, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC167Q9P0B6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC167Q9P0B6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms