Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms