Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms