Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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LHX9Q9NQ69 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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