Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F12Q9HCS2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms