Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB1BQ9H0U4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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