Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHACTR1Q9C0D0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms