Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM31Q9BZY9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM31Q9BZY9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms