Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms