Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms