Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms