Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms