Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms