Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms