Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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