Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms