Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms