Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms