Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms