Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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