Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOMQ8WWX9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOMQ8WWX9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms