Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PBRM1Q86U86 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms